英國劍橋大學計算生物學教授帕特里克·貝爾(Patrick?。拢澹欤欤┻@樣評價到AI:"人工智能的力量在于它能夠從復雜且龐大的數(shù)據(jù)集中提取出深層次的模式,這對于疾病預測具有革命性的意義。"
隨著人工智能技術在醫(yī)療領域的飛速發(fā)展,AI在疾病預測中的應用已經成為一個熱門話題。越來越多的研究表明,AI可以提升疾病的早期預測能力。本文將分享三項基于人工智能的疾病預測最新的研究成果,看看它們如何在不同領域實現(xiàn)突破,帶來疾病預測的新未來。
1.?。粒稍诨驅用娴募膊★L險預測
據(jù)尚學群教授及其團隊于2024年發(fā)表的《DeepRisk: A?。洌澹澹稹。欤澹幔颍睿椋睿纭。幔穑穑颍铮幔悖琛。妫铮颉。纾澹睿铮恚澹鳎椋洌濉。幔螅螅澹螅螅恚澹睿簟。铮妗。悖铮恚恚铮睢。洌椋螅澹幔螅濉。颍椋螅搿氛撐谋硎觯瑘F隊開發(fā)了基于AI的DeepRisk模型,旨在為個體提供精準的常見疾病風險預測。這項研究利用人工智能對基因數(shù)據(jù)進行深度學習,解決了傳統(tǒng)基因風險評估方法無法充分捕捉基因間復雜關系的難題。DeepRisk模型的核心依賴于兩大模塊:基因編碼模塊和疾病預測模塊。首先,基因編碼模塊將基因中的單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點及其與基因的從屬關系編碼成特征向量。這一特征向量的兩個維度分別代表風險等位基因和非風險等位基因,避免了傳統(tǒng)方法中的數(shù)量偏差。而在疾病預測模塊中,研究團隊引入了深度學習中的雙向長短期記憶網(wǎng)絡(BiLSTM)和部分連接層。通過部分連接層,模型能夠捕捉SNP與基因以及基因間的復雜交互,尤其是利用SNP與其相關基因之間的位置從屬關系將更可能發(fā)生交互作用的SNP位點進行有效連接,從而提供更準確的疾病風險預測?!荆薄?/p>
研究團隊通過基于英國生物樣本庫中約50萬人的龐大數(shù)據(jù)集進行評估,DeepRisk模型展現(xiàn)了顯著的優(yōu)勢。與當前最先進的基于多基因風險評分(PRS)的方法相比,DeepRisk在預測四種公共疾?。ò柎暮D?、炎癥性腸病、2型糖尿病及乳腺癌)的性能上均取得了最高8%的提升。尤其在炎癥性腸病的風險預測中,DeepRisk顯示出了其強大的篩查能力。
研究表明,使用DeepRisk模型篩查人群中的高風險個體時,風險得分最高的4.19%的人群,其炎癥性腸病的易感風險是普通人群的三倍以上。而得分最高的0.29%人群的炎癥性腸病風險則增加了超過五倍,這表明DeepRisk可以高效地識別出疾病高風險群體,并為他們提供精準的早期干預建議。
2.?。粒深A測致命心臟疾病風險
2024年外國Caristo Diagnostics公司研究團隊發(fā)表了AI心血管疾病診斷和風險預測領域的研究論文《Inflammatory?。颍椋螅搿。幔睿洹。悖幔颍洌椋铮觯幔螅悖酰欤幔颉。澹觯澹睿簦蟆。椋睢。穑幔簦椋澹睿簦蟆。鳎椋簦瑁铮酰簟。铮猓螅簦颍酰悖簦椋觯濉。悖铮颍铮睿幔颍。幔颍簦澹颍。洌椋螅澹幔螅澹骸。簦瑁濉。希遥疲粒巍。恚酰欤簦椋悖澹睿簦颍?,?。欤铮睿纾椋簦酰洌椋睿幔臁。悖铮瑁铮颍簟。螅簦酰洌?。論文指出其開發(fā)的CaRi-Heart?AI已經成為心血管疾病風險評估的重要工具。該技術通過量化冠狀動脈炎癥,結合人工智能算法,能夠預測患者未來發(fā)生心臟事件的風險,特別是在無明顯冠狀動脈阻塞的患者中。CaRi-Heart AI技術的核心是其通過脂肪衰減指數(shù)(FAI)評分系統(tǒng),對冠狀動脈炎癥進行量化,以此評估患者的心血管風險。CaRi-Heart技術結合傳統(tǒng)的臨床風險因素(如年齡、血壓、膽固醇水平等),加入了炎癥因子和冠狀動脈粥樣硬化的程度,綜合所有數(shù)據(jù)以提供更為全面的風險預測。特別是在那些沒有明確冠狀動脈阻塞的患者中,CaRi-Heart能夠揭示潛在的高風險,給臨床醫(yī)生提供額外的疾病管理線索?!荆病?/p>
在臨床研究中,Caristo?。模椋幔纾睿铮螅簦椋悖蠊緦Γ矗埃埃埃岸嗝邮芄跔顒用}計算機斷層血管造影(CCTA)的患者進行了長期跟蹤,并取得了突破性成果。研究表明,超過80%的接受CCTA檢查的患者,在成像時并未顯示出明顯的冠狀動脈阻塞(即非阻塞性冠狀動脈疾病,CAD),然而,這部分患者發(fā)生致命或非致命心臟事件的風險卻是有冠狀動脈阻塞患者的兩倍。
通過Caristo的CaRi Heart?。疲粒伞。樱悖铮颍?測量,冠狀動脈炎癥的量化指標能夠有效預測這些心臟事件,且這一預測能夠提前至少10年。而即使在初次CCTA檢查中沒有明顯的冠狀動脈斑塊,或斑塊極少的患者中,FAI評分異常的患者,其心臟死亡風險也高出9.5倍,主要不良心臟事件(MACE)的風險則高出5.5倍。CaRi-Heart AI技術通過識別炎癥驅動的風險,為沒有明顯心血管病變的患者提供了有效的早期警告,從而為臨床干預提供了更早的時間窗口。
3.AI預測急性白血病亞型
急性白血病(AML)、急性早幼粒細胞白血?。ǎ粒校蹋┖图毙粤馨图毎籽。ǎ粒蹋蹋┦侨N常見且危及生命的白血病亞型。傳統(tǒng)上,急性白血病的診斷依賴于細胞學、免疫表型和分子生物學等綜合方法,這一過程往往需要數(shù)天時間,且對臨床醫(yī)生的經驗要求較高。
為了彌補這一不足,法國的多中心研究團隊開發(fā)了一個基于常規(guī)實驗室參數(shù)的機器學習模型--AI-PAL,旨在通過自動化分析血液和骨髓樣本中的實驗室數(shù)據(jù),提前識別白血病亞型,從而加速診斷過程,并為患者提供更早的治療干預。
根據(jù)團隊2024年發(fā)表在LANCET子刊The Lancet?。模椋纾椋簟。龋澹幔欤簦瑁ǎ桑疲剑常埃福┥系摹叮牛觯幔欤酰幔簦椋铮睢。铮妗。帷。恚幔悖瑁椋睿澹欤澹幔颍睿椋睿纭。恚铮洌澹臁。猓幔螅澹洹。铮睢。欤幔猓铮颍幔簦铮颍。穑幔颍幔恚澹簦澹颍蟆。妫铮颉。簦瑁濉。穑颍澹洌椋悖簦椋铮睢。铮妗。幔悖酰簦濉。欤澹酰耄幔澹恚椋帷。螅酰猓簦穑澹螅骸。帷。恚酰欤簦椋悖澹睿簦颍濉。恚铮洌澹臁。洌澹觯澹欤铮穑恚澹睿簟。幔睿洹。觯幔欤椋洌幔簦椋铮睢。螅簦酰洌。椋睢。疲颍幔睿悖濉飞系恼撐乃?,AI-PAL模型的核心思想是將常規(guī)臨床實驗室參數(shù)轉化為能夠有效預測急性白血病(AML)、急性早幼粒細胞白血?。ǎ粒校蹋┖图毙粤馨图毎籽。ǎ粒蹋蹋﹣喰偷奶卣髯兞?。利用血液和骨髓常規(guī)檢測結果,形成多維度的實驗數(shù)據(jù)輸入,并通過機器學習算法分析這些變量之間的復雜關聯(lián),從而對三種不同亞型的急性白血病進行準確預測。AI-PAL模型利用10倍交叉驗證和自定義網(wǎng)格搜索對變量進行排序,通過分析變量對預測結果的影響,逐步篩選出與白血病亞型密切相關的關鍵因素。通過特征選擇和靈敏度分析,最終篩選出了10個最具判別能力的變量,這些變量被輸入到機器學習模型中用于訓練。在數(shù)據(jù)預處理和特征選擇后,AI-PAL模型采用了極端梯度增強(XGB)算法進行建模。通過構建一系列的決策樹進行增強學習,逐步提高預測準確性。【3】
通過10次重復交叉驗證和隨機網(wǎng)格搜索超參數(shù)調整,研究團隊精確地調優(yōu)了模型性能,最終模型在內部測試集和外部驗證集上的AUC分別達到:APL預測AUC:0.97(95%?。茫伞。埃梗担埃梗梗?;ALL預測AUC:0.90(95% CI?。埃福常埃梗罚唬粒停填A測AUC:0.89(95%?。茫伞。埃福玻埃梗担?。這些高AUC值表明該模型在實際應用中具有極高的準確性,能準確預測急性白血病亞型,為針對性的治療爭取時間。
結語
從基因組數(shù)據(jù)分析的疾病預測到心血管疾病預測、再到急性白血病的亞型預測,AI通過從海量數(shù)據(jù)中提取出潛在的疾病模式,展示了其在精準疾病預測中的巨大潛力。隨著數(shù)據(jù)的不斷積累與AI技術的日益成熟,AI將在未來更加廣泛地應用于疾病預測,改變我們每個人的體檢流程。
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